2006年2月9日，“三峡库区及其上游水污染防治战略咨询”项目第一阶段咨询报告讨论会在京召开。会议由沈国舫副院长主持，国务院三峡工程建设委员会办公室高金榜副主任、魏复盛、刘鸿亮、金鉴明、张懿、陆佑楣等院士及相关专家共计16人参加。
　　经过一年来的研究，项目组初步形成了“关于将三峡库区及其上游作为特殊保护水域，切实促进经济社会环境协调发展的建议”的阶段咨询报告（草案）。

　　报告（草案）从三峡库区及其上游水污染的现状与问题、三峡库区及其上游作为特殊保护水域的必要性与紧迫性以及八项建议等三个方面展开陈述，认为三峡库区及其上游水污染防治工作应以科学发展观为指导，以水污染防治为主线，贯彻在发展中保护，保护促进发展的“双赢”战略方针；以农村面源污染防治为重点，以促进农村生态型循环经济发展为切入点；坚持经济发展与环境保护并重，法律、经济、行政、技术手段并举，预防为主防治结合，全面规划突出重点相结合，措施的科学性与可操作性相协调，近期与中长期发展统筹，上下游兼顾，工业、农业、生活污染、船舶污染共治的原则，切实降低环境污染来保护长江三峡这盆清水。

　　与会专家围绕“特殊保护水域如何定位”这一焦点问题展开了激烈的讨论，并对报告提出的一些建议进行了认真磋商后，一致同意报告的主体提纲，并认为“特殊水域”应作为贯穿报告的主线，但库区和上游及影响区应分类管理，区别对待。

　　沈国舫副院长指出，三峡库区及其上游水污染防治工作一定要落实科学发展观，探索以保护求发展的新型模式。但对于库区和上游及影响区的分类定位应讲求策略，要兼顾到地方经济发展的需要，切实促进这一区域的全面、协调发展。

　　课题组组长魏复盛院士最后表示，将尽快综合各位专家的意见，修改、完善阶段报告，力争在2月底以中国工程院名义发送给有关部委及省市，为《三峡库区及其上游污染防治的“十一·五”规划》提供一些决策依据。